Отец Феофан с 2011 года служил архиепископом Челябинским и Златоустовским. За время его пребывания вернулся Российской православной церкви челябинский храм Александра Невского на Алом поле, в котором до этого находился орган.
В 2012 году Священный синод, заслушав доклад архиепископа Феофана об образовании новых епархий в Челябинской области, создал Троицкую и Магнитогорскую епархии с образованием Челябинской митрополии.
В сан митрополита возведен в 2012 году.
Также Феофан подписал соглашения о сотрудничестве с силовыми структурами. При нём открылся ряд новых храмов, активизировалась реконструкция старых.
Митрополит стал инициатором введения в южноуральских школах предмета, изучающего основы мировых вероисповеданий.
Подданный церкви наладил взаимоотношения с властью Челябинской области, тогда главой которой был Михаил Юревич, и добился превращения Челябинской и Златоустовской епархии в митрополию из трёх епархий».
В 2015 году был назначен ректором Казанской духовной семинарии.
Отец Феофан в начале пандемии выступал против закрытия церквей на карантин и считал, что Бог спасет всех от этой «заразы»:
«Сейчас идет Великий пост, поэтому в церквях довольно много верующих. Необходимости закрывать храмы пока нет. Люди, к слову, посещают в настоящее время не только церкви, но и магазины, рынки, кинотеатры… Храм для верующих — место общения с Богом. Они верят, что Он спасет их от чумы, коронавируса и других напастей. Вы ведь понимаете, что можно заразиться инфекцией, даже не посещая храм и не прикладываясь к иконам. Закрытие храмов может вызвать панику, а паника — самый страшный вирус. Она может принести вреда больше, чем коронавирус. Паника вызывает потерю самоконтроля»,
— пояснял тогда глава епархии.
Умер Иван Ашурков (мирское имя священнослужителя) утром 20 ноября 2020 года от осложнений, вызванных коронавирусом.